Crash Bandicoot 2: Cortex Strikes Back es un juego de plataformas en el que el jugador controla a Crash Bandicoot, que debe reunir 25 cristales de su némesis Doctor Neo Cortex. El juego se desarrolla en una serie de "Warp Rooms", que actúan como las áreas del cubo del juego.

Cada Warp Room contiene cinco puertas, cada una de las cuales conducen a un nivel. El objetivo de cada nivel es obtener el cristal colocado en algún lugar a lo largo del camino. Un nivel se borra mediante la recopilación de cristal y de alcanzar el final de la ruta, que devuelve a la habitación Crash Warp. Recuperando el cristal en un nivel hará que el cristal que aparezca en la ranura en forma de cristales sobre la puerta de nivel en la habitación Warp.